186 COMPUTER HARDWARE, SOFTWARE
- (a) Albinati , A. ; Lianza , F. ; Berger , H. ; Pregosin , P. S. ; R ü egger , H. ; Kunz , R. W.
Inorg. Chem ., 1993 , 32 , 478. (b) Hay , B. P. ; Rustad , J. R. J. Am. Chem. Soc ., 1994 , 116 ,
6313. - (a) Halgren , T. A. J. Am. Chem. Soc ., 1992 , 114 , 7827. (b) Halgren , T. A. J. Comp.
Chem ., 1996 , 17 , 490 , 520 , 553. - Gajewski , J. J. ; Gilbert , K. E. ; McKelvey , J. In Advances in Molecular Modeling ,
Vol. 2, Liotta , D. , ed., JAI Press , Greenwich, CT , 1990 , p. 65. - Lipkowitz , K. B. ; Pearl , G. M. ; Robertson , D. H. ; Schultz , F. A. J. Chem. Ed ., 1996 ,
73 ( 2 ), 105. - Hancock , R. D. ; Dobson , S. M. ; Evers , A. ; Wade , P. W. ; Ngwenya , M. P. ; Boeyens ,
J. C. A. ; Wainwright , K. P. J. Am. Chem. Soc ., 1988 , 110 , 2794. - Adam , K. R. ; Antolovich , M. ; Brigden , L. G. ; Lindoy , L. F. J. Am. Chem. Soc ., 1991 ,
113 , 3346. - Allured , V. S. ; Kelly , C. M. ; Landis , C. R. J. Am. Chem. Soc ., 1991 , 113 , 1.
- (a) Rapp é , A. K. ; Casewit , C. J. ; Colwell , K. S. ; Goddard , W. A. , III ; Skiff , W. M.
J. Am. Chem. Soc ., 1992 , 114 , 10024. (b) Casewit , C. J. ; Colwell , K. S. ; Rapp é , A. K.
J. Am. Chem. Soc ., 1992 , 114 , 10046. (c) Rapp é , A. K. ; Colwell , K. S. ; Casewit ,
C. J. Inorg. Chem ., 1993 , 32 , 3438. - Grant , G. H. ; Richards , W. G. Computational Chemistry , Oxford University Press ,
New York , 1996. - Karplus , M. ; Petsko , G. A. Nature , 1990 , 347 , 631 – 639.
- Lopez , M. A. ; Kollman , P. A. J. Am. Chem. Soc ., 1989 , 111 , 6212.
- Charles , R. ; Ganly - Cunningham , M. ; Warren , R. ; Zimmer , M. J. Mol. Struct ., 1992 ,
265 , 385. - Collins , J. R. ; Du , P. ; Loew , G. H. Biochemistry , 1992 , 31 , 11166.
- Kuczera , K. ; Kuriqan , J. ; Karplus , M. J. Mol. Biol ., 1990 , 213 , 351.
- Zhang , Z. ; Huang , L. ; Shulmeister , V. M. ; Chi , Y. - I. ; Kim , K. K. ; Hung , L. - W. ;
Crofts , A. R. ; Berry , E. A. ; Kim S. - H. Nature , 1998 , 392 , 677 – 684. (PDB: 1BCC,
3BCC) - Izrailev , S. ; Crofts , A. R. ; Berry , E. A. , Schulten , K. S. Biophys. J ., 1999 , 77 ,
1753 – 1768. - Nelson , M. ; Humphrey , W. ; Gursoy , A. ; Dalke , A. ; Kal é , L. ; Skeel , R. D. ; Schulten ,
K. Int. J. Supercomput. Appl. High Perform. Comput ., 1996 , 10 , 251 – 268. - (a) MacKerell , A. D. , Jr .; Wiorkiewicz - Kuczera , J. ; Karplus , M. J. Am. Chem. Soc .,
1995 , 117 , 11946 – 11975. (b) MacKerell , A. D. , Jr .; Bashford , D. ; Bellott , D. ; Dun-
brack , R. L. , Jr .; Evanseck , J. ; Field , M. J. ; Fischer , S. ; Gao , J. ; Guo , H. ; Ha , S. ; Joseph ,
D. ; Kuchnir , L. ; Kuczera , K. ; Lau , F. T. K. ; Mattos , C. ; Michnick , S. ; Ngo , T. ; Nguyen ,
D. T. ; Prodhom , B. , Reiher , I. W. E. ; Roux , B. ; Schlenkrich , M. ; Smith , J. ; Stote , R. ;
Straub , J. ; Watanabe , M. ; Wiorkiewicz - Kuczera , J. ; Yin , D. ; Karplus , M. J. Phys. Chem.
B , 1998 , 102 , 3586 – 3616. (c) Schlenkrich, M.; Brickmann, J.; MacKerell, A. D.,
Jr.; Karplus, M. In Merz, K. M.; Roux, B., eds., Biological Membranes: A
Molecular Perspective from Computation and Experiment , Birkhauser, Boston,
1996, pp. 31 – 81. - Frisch , M. J. ; Trucks , G. W. ; Schlegel , H. B. ; Gill , P. M. W. ; Johnson , B. G. ; Robb ,
M. A. ; Cheeseman , J. R. ; Keith , T. ; Petersson , G. A. ; Montgomery , J. A. ; Raghavachari ,
K. ; Al - Laham , M. A. ; Zakrzewski , V. G. ; Ortiz , J. V. ; Foresman , J. B. ; Peng , C. Y. ;